207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0689 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  42.7 
 
 
191 aa  151  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  43.5 
 
 
189 aa  148  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  38.67 
 
 
183 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  38.12 
 
 
183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  36.81 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  39.46 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  33.71 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  29.05 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  29.21 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  31.68 
 
 
209 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  31.18 
 
 
221 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  30.54 
 
 
210 aa  85.5  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  32.1 
 
 
211 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  35.59 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  30.64 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  30.49 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  29.69 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  28.99 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  31.45 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  25.27 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  30.06 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  31.4 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  29.35 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  25.27 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  26.04 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  31.64 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  27.78 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  24.19 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  28.49 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  29.63 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  24.19 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  35.51 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  29.55 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  34.51 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  37.78 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  38 
 
 
244 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  28.88 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  32.87 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  35.56 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  39 
 
 
236 aa  64.3  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  34.44 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  35.05 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  29.28 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  34.02 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  35.05 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  36.36 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  35.05 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  34.02 
 
 
254 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  35.05 
 
 
243 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  25.28 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  35.64 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  31.68 
 
 
229 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  24.32 
 
 
237 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  34.75 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  29.35 
 
 
223 aa  61.6  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  33.66 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  28.78 
 
 
342 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  35.05 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  32.46 
 
 
220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  28.89 
 
 
241 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  28.89 
 
 
241 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  28.89 
 
 
241 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  31.07 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  31.07 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  31.07 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  33.71 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  28.89 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  31.07 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  31.07 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  28.89 
 
 
242 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  32.04 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  35.09 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  25.56 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  36.73 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  33.67 
 
 
222 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  32.04 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  35.92 
 
 
231 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  28.89 
 
 
254 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  32.04 
 
 
236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  31.73 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  30.29 
 
 
228 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  29.52 
 
 
236 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  34.83 
 
 
223 aa  58.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  29.13 
 
 
219 aa  57.8  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  34 
 
 
241 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  31.82 
 
 
218 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  30.09 
 
 
231 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  34 
 
 
241 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>