117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3122 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  800    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  29.85 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  31.9 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  32.99 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.24 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  33.16 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  34.01 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  33.16 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  34.01 
 
 		 379 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  30.1 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  33.33 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  33.67 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.17 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  28.79 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  26.73 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.38 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  26.15 
 
 		 360 aa  92.8  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.91 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  30.62 
 
 		 332 aa  90.1  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  30.46 
 
 		 347 aa  89.4  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  31.91 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  29.71 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  31.86 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  29.79 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  30.54 
 
 		 332 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  31.02 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  30.46 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  28.01 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  28.94 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  29.81 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  32.83 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  24.75 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  26.69 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  22.5 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  27.35 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.49 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  21.43 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  23.5 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  23.5 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  24.93 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  32.16 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  26.82 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  28.82 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  28.5 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  31.33 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  23.82 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  26.02 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.83 
 
 		 521 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  27.14 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  22.84 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  25.64 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0120  ATPase  26.8 
 
 		 863 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000637349 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  28.35 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6943  ATP-dependent chaperone ClpB  22.34 
 
 		 860 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  22.71 
 
 		 873 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5193  ATP-dependent chaperone ClpB  29.03 
 
 		 874 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  28.23 
 
 		 867 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0121  ATPase  26.14 
 
 		 863 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6458  ATP-dependent chaperone ClpB  28 
 
 		 864 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  29.03 
 
 		 848 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  29.03 
 
 		 848 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0467  ATPase  29.03 
 
 		 848 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2431  ATP-dependent chaperone ClpB  29.03 
 
 		 865 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.500769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0246  ATPase  28.12 
 
 		 848 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  31.15 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  30.23 
 
 		 871 aa  46.6  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  29.37 
 
 		 871 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  28.23 
 
 		 848 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  25.49 
 
 		 859 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  27.56 
 
 		 368 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  27.56 
 
 		 368 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18660  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  27.42 
 
 		 864 aa  46.2  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0343027  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4356  ATPase AAA-2  29.03 
 
 		 869 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4357  ATPase  28.23 
 
 		 866 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2815  ATPase  28.68 
 
 		 870 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565756  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  24.83 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12530  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  28.23 
 
 		 881 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0853333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  28.68 
 
 		 870 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  29.03 
 
 		 870 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0075  ATPase  28.68 
 
 		 870 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0715422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4582  ATP-dependent chaperone ClpB  29.84 
 
 		 899 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.994728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05550  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  26.61 
 
 		 865 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3479  ATP-dependent chaperone ClpB  27.42 
 
 		 880 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0234  ATP-dependent chaperone ClpB  26.61 
 
 		 863 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  27.42 
 
 		 889 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3161  ATP-dependent chaperone ClpB  27.42 
 
 		 871 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3422  ATPase  26.61 
 
 		 867 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.04082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0229  ATPase  28.23 
 
 		 870 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  27.42 
 
 		 864 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0546  ATP-dependent chaperone ClpB  27.42 
 
 		 865 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  27.42 
 
 		 861 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0494  ATP-dependent chaperone ClpB  27.42 
 
 		 846 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4102  ATP-dependent chaperone ClpB  28.23 
 
 		 850 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0130  ATPase AAA-2  28.68 
 
 		 872 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  26.92 
 
 		 868 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  24.63 
 
 		 864 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10389  endopeptidase ATP binding protein subunit B clpB  28.03 
 
 		 848 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000533203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4216  ATPase AAA-2 domain protein  27.42 
 
 		 878 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0815714  normal  0.193469 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>