More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2205 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 343 aa  692    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0335874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.35 
 
 		 338 aa  355  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.37 
 
 		 344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.08 
 
 		 337 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  54.32 
 
 		 341 aa  349  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 		 354 aa  348  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 		 337 aa  348  7e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 		 338 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.22 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.54 
 
 		 338 aa  345  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.13 
 
 		 339 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 355 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.15 
 
 		 354 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.31 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.65 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  55.31 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.57 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.95 
 
 		 336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.29 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.95 
 
 		 347 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.56 
 
 		 341 aa  342  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.92 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.41 
 
 		 356 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 356 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.11 
 
 		 343 aa  342  7e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 347 aa  342  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.7 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.05 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.63 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.19 
 
 		 351 aa  339  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.8 
 
 		 343 aa  338  5e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.77 
 
 		 342 aa  338  5e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.96 
 
 		 370 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.58 
 
 		 344 aa  338  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 347 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.84 
 
 		 338 aa  338  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.7 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.05 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  52 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.05 
 
 		 352 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.75 
 
 		 355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.37 
 
 		 341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 		 351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.63 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.5 
 
 		 357 aa  335  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 		 340 aa  335  5e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 		 343 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.59 
 
 		 343 aa  335  7e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.44 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.08 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.08 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.48 
 
 		 541 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 336 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  50.6 
 
 		 342 aa  332  6e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.04 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 		 354 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.43 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 336 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 336 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 333 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0152  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 		 347 aa  332  7.000000000000001e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00761409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.3 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.3 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.51 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.65 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.41 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.28 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.58 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.65 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.28 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  50.9 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.13 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.42 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  50 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  51.84 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.98 
 
 		 356 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.99 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.99 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.99 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.99 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.48 
 
 		 333 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.98 
 
 		 356 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  51.99 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0989  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.1 
 
 		 320 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.137899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>