More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2186 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  100 
 
 
396 aa  801    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  44.3 
 
 
398 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  41.98 
 
 
396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  42.97 
 
 
397 aa  329  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  40.97 
 
 
396 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  43 
 
 
398 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  42.64 
 
 
397 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  41.54 
 
 
400 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  40.55 
 
 
397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  41.62 
 
 
397 aa  316  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  39.54 
 
 
397 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  41.78 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  41.51 
 
 
396 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  39.49 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  40.4 
 
 
405 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  40.41 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  39.42 
 
 
385 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  39.29 
 
 
394 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  40.66 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  39.43 
 
 
390 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  39.64 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  39.22 
 
 
387 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  39.12 
 
 
390 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  38.71 
 
 
389 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  33.51 
 
 
397 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  32.54 
 
 
397 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  34.29 
 
 
397 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  34.74 
 
 
399 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  33.94 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  34.82 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  32.98 
 
 
397 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  34.64 
 
 
407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  32.73 
 
 
398 aa  207  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  32.72 
 
 
398 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  32.37 
 
 
397 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  31.48 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  34.38 
 
 
399 aa  193  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  32.39 
 
 
407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  31.69 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  32.03 
 
 
419 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  31.11 
 
 
414 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  29.69 
 
 
408 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  28.53 
 
 
353 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  29.68 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.58 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  27.18 
 
 
364 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  27.4 
 
 
353 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25 
 
 
365 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  28.54 
 
 
353 aa  123  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  28.54 
 
 
353 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  28.54 
 
 
353 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  28.54 
 
 
353 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.44 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  28.54 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  28.76 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.44 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  28.54 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  25.76 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.19 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.53 
 
 
353 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.44 
 
 
365 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.44 
 
 
365 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  28.28 
 
 
353 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.44 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.44 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  27.65 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  31.44 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  27.11 
 
 
393 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.19 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.94 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  25.5 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  25.19 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  24.94 
 
 
356 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  24.94 
 
 
356 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.68 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  29.87 
 
 
353 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  27.89 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  23.92 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  27.48 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  25 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  30.07 
 
 
365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.51 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  24.74 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  26.92 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  24.42 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  28.95 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  27.27 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  25.52 
 
 
369 aa  111  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.43 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  24.24 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  24.68 
 
 
352 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  25.19 
 
 
362 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  25.31 
 
 
356 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  25.98 
 
 
363 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  26.98 
 
 
359 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  26.54 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  27.25 
 
 
388 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  27.2 
 
 
367 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  24.81 
 
 
369 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  25.37 
 
 
356 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>