More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1456 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
257 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  61.36 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  65.62 
 
 
256 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  65.62 
 
 
256 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.94 
 
 
260 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  62.15 
 
 
258 aa  298  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.96 
 
 
264 aa  298  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  63.75 
 
 
257 aa  296  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  61.18 
 
 
266 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.39 
 
 
255 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  60.78 
 
 
260 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  59.61 
 
 
261 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  58.43 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  65.74 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  64.9 
 
 
245 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 
259 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  61.22 
 
 
253 aa  280  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  64.89 
 
 
254 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  64.89 
 
 
254 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  64.89 
 
 
254 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  60.87 
 
 
252 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  59.69 
 
 
267 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.53 
 
 
254 aa  275  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  61.29 
 
 
265 aa  271  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  61.18 
 
 
259 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  64.98 
 
 
258 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  63.14 
 
 
252 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  60.87 
 
 
253 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  59.13 
 
 
248 aa  255  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  59.77 
 
 
274 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 
255 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  62.95 
 
 
262 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  59.61 
 
 
274 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  62.22 
 
 
292 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  52.48 
 
 
296 aa  237  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  54.31 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  53.9 
 
 
271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.85 
 
 
234 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.3 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
264 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
273 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
259 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.36 
 
 
269 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
271 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  39.73 
 
 
259 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.52 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
263 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.12 
 
 
257 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  42.5 
 
 
257 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  42.5 
 
 
257 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  38.57 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
287 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.95 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
256 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 
268 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  42.71 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  42.71 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  42.71 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.16 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
266 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  34.32 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.79 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.57 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0876  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.53 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.84 
 
 
258 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  39.17 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
254 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
261 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.07 
 
 
258 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.24 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  43.81 
 
 
254 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
258 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
253 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
259 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0650  putative crotonase  37.16 
 
 
252 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
254 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.12 
 
 
255 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
258 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
265 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
257 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>