39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1023 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1023  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1103    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.452518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2425  hypothetical protein  29.76 
 
 		 556 aa  193  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000103631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1158  hypothetical protein  24.28 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.815616  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0564  hypothetical protein  26.91 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.242049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2557  hypothetical protein  23.62 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0304  hypothetical protein  24.34 
 
 		 422 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0501  hypothetical protein  25.28 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3539  hypothetical protein  25.59 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3707  hypothetical protein  23.84 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1030  hypothetical protein  22.62 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.417426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2712  hypothetical protein  23.99 
 
 		 418 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1661  hypothetical protein  25.06 
 
 		 885 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  26.07 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0305  hypothetical protein  20.28 
 
 		 534 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  21.4 
 
 		 1367 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  22.25 
 
 		 1059 aa  52  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.18 
 
 		 695 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  23.01 
 
 		 717 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.14 
 
 		 1481 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  23.73 
 
 		 969 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  24.41 
 
 		 572 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.63 
 
 		 298 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  24.4 
 
 		 427 aa  47.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  22.12 
 
 		 1553 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  22.07 
 
 		 720 aa  47  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  20.93 
 
 		 1348 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.27 
 
 		 1209 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1229 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  21.16 
 
 		 590 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.25 
 
 		 1357 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.73 
 
 		 919 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  20.52 
 
 		 1510 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.94 
 
 		 1211 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  19.96 
 
 		 1552 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.52 
 
 		 1240 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1714 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.84 
 
 		 1583 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  27.7 
 
 		 1062 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>