More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_501 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  97.81 
 
 		 503 aa  1001    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.1 
 
 		 503 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  61.89 
 
 		 509 aa  634    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.93 
 
 		 502 aa  673    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  64.53 
 
 		 507 aa  676    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 		 503 aa  1018    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  66.33 
 
 		 507 aa  677    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2799  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 		 513 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.42 
 
 		 506 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.53 
 
 		 501 aa  689    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.69 
 
 		 503 aa  646    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  95.22 
 
 		 503 aa  972    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  62.75 
 
 		 507 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.38 
 
 		 517 aa  641    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0283869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  63.35 
 
 		 541 aa  662    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.3 
 
 		 503 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.95 
 
 		 502 aa  655    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 		 507 aa  645    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  64.48 
 
 		 507 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.43 
 
 		 502 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.69 
 
 		 503 aa  646    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  63.33 
 
 		 501 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.08 
 
 		 527 aa  634    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.709885  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.55 
 
 		 502 aa  645    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3496  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.98 
 
 		 513 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.225453  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.23 
 
 		 502 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  68.8 
 
 		 508 aa  715    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  61.12 
 
 		 508 aa  638    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.97 
 
 		 505 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  64.2 
 
 		 504 aa  650    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.83 
 
 		 505 aa  634    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.6 
 
 		 505 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.83 
 
 		 502 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.83 
 
 		 502 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.88 
 
 		 503 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.54 
 
 		 509 aa  631  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.13 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.13 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.24 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.24 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.88 
 
 		 503 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0213  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 514 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.03 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0308  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 		 513 aa  629  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0176346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.08 
 
 		 526 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.793474  normal  0.559767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2746  ATP synthase F1, alpha subunit  60.31 
 
 		 513 aa  630  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.426504  normal  0.209432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.27 
 
 		 522 aa  628  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.746829 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.17 
 
 		 504 aa  629  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 		 507 aa  631  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.83 
 
 		 503 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3189  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.18 
 
 		 513 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0878221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.44 
 
 		 505 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3055  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.84 
 
 		 517 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2912  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.64 
 
 		 517 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 		 513 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.45 
 
 		 502 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.64 
 
 		 505 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.65 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3029  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.35 
 
 		 513 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.24 
 
 		 512 aa  627  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 		 502 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.96 
 
 		 505 aa  625  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.64 
 
 		 504 aa  626  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.45 
 
 		 502 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  61.16 
 
 		 502 aa  624  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 502 aa  621  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.24 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3013  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 		 502 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3319  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 513 aa  621  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162911  decreased coverage  0.00532822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4044  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.98 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2955  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.98 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  hitchhiker  0.00052948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.05 
 
 		 505 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3348  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 		 513 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0181  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.98 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.52 
 
 		 506 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3310  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 513 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0120  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 		 513 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0038  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.57 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  61.63 
 
 		 506 aa  623  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2951  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 		 513 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1589  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0095  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 		 513 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88314  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3970  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.98 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.56 
 
 		 526 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 		 513 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3357  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.8 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2809  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 514 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0629727  normal  0.24519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 505 aa  618  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3205  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 514 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.24 
 
 		 504 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.45 
 
 		 504 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>