151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0076 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  87.65 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.0000012405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0050  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0025  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0026  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0072  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0073  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0076  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737133  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0079  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.966299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0024  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0024  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0037  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17135  normal  0.776036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  82.72 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>