More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3267 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  100 
 
 
124 aa  247  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  44.72 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
137 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  51.59 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  51.59 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  49.21 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  50.4 
 
 
134 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  50.79 
 
 
137 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  49.21 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
144 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  48.76 
 
 
135 aa  103  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  46.83 
 
 
129 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  46.28 
 
 
134 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  38.78 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1481  camphor resistance CrcB protein  44.12 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  34.43 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  40.68 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  35.96 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  34.23 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.83 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  45.33 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  45.33 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.58 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  40 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.18 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  39.13 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  38.18 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  37.93 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  38.74 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40.91 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.07 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  37.25 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  37.61 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.04 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  38.26 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  33.06 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  37.61 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  43.48 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  31.36 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.54 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  38.52 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  34.75 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  34.4 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  36.11 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  39 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  40 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  42.42 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  37 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  40.74 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.63 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>