58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1888 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1888  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 307 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0933  Polysulphide reductase NrfD  55.56 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.702618  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.33 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  26.93 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2456  Polysulphide reductase NrfD  28.52 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  26.07 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  27.22 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  27.56 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  25 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  26.86 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1965  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  28.52 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  26.91 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1872  Polysulphide reductase NrfD  28.33 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  31.21 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  33.73 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.38 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  27.76 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  25.14 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  27.91 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  26.47 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  24.42 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0242  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.44 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  25.24 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1367  Polysulphide reductase NrfD  25.5 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  25.97 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3984  polysulphide reductase, NrfD  24.21 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  25.31 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  26.02 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  25.32 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3178  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  24.51 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0516  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  25.57 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0936  polysulphide reductase, NrfD  28.65 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00000369278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  29.1 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  26.4 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  43.33 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  25.83 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  18.95 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2917  Polysulphide reductase NrfD  28.8 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  26.07 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  27.07 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.89 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0493  polysulphide reductase, NrfD  27.24 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  23.84 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  23.7 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  26.58 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  26.07 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  26.07 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0309  Polysulphide reductase NrfD  27.53 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000856639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  25.24 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  27.27 
 
 		 402 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  25.57 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0658  Polysulphide reductase NrfD  28.09 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.245596  hitchhiker  0.00748855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3245  polysulphide reductase, NrfD  24.75 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  23.83 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  25.58 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  25.57 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3872  polysulphide reductase NrfD  26.91 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>