More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1607 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 113 aa  236  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 114 aa  204  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  58.33 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  57.73 
 
 		 110 aa  124  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  60.22 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  56.07 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  51.46 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  58.59 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  53.61 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  60.82 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  51.43 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  51.43 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  53.68 
 
 		 111 aa  116  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  50.5 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  56.52 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  52.08 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  53.12 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  58.76 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  58.76 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  58.76 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  58.76 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  58.76 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  58.76 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  58.16 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  54.55 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  54.55 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  54.55 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  54.55 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  54.55 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  54.55 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  54.55 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  54.55 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  57.73 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  57.73 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  53 
 
 		 114 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  51.02 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  51.09 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  50.52 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  55.21 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  55.1 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  55.1 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  55.1 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  55.1 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  56.7 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  48.48 
 
 		 132 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  54.55 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  55.21 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  55.21 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  54.17 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  46.15 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  44.34 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 119 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  56.04 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  53.12 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 129 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  49.49 
 
 		 159 aa  103  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  53.12 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>