244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0874 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  61.05 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  62.35 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  62.96 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  62.96 
 
 		 208 aa  214  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  60.37 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  58.68 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  50 
 
 		 202 aa  185  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  47.28 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  47.96 
 
 		 197 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  51.46 
 
 		 196 aa  177  7e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  50 
 
 		 201 aa  174  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  47.15 
 
 		 193 aa  174  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  47.15 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  53.05 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  47.15 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  48.44 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  49.2 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  45.69 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  46.43 
 
 		 193 aa  168  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  46.77 
 
 		 203 aa  168  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  45.13 
 
 		 195 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  50.56 
 
 		 220 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  46.63 
 
 		 244 aa  167  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  49.74 
 
 		 210 aa  167  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  45.96 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  46.27 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  45.96 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  45.7 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  44.27 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  47.96 
 
 		 218 aa  164  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  49.38 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  45.88 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  49.44 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  49.44 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  47.98 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  49.44 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  49.44 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  49.44 
 
 		 226 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  49.44 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  49.44 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  48.68 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  43.26 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  47.37 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  46.77 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  45.36 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  44.81 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  47.8 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  44.38 
 
 		 184 aa  157  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  44.81 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  49.43 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  44.09 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  43.72 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  43.72 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  45.03 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  43.65 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  42.56 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  46.24 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  43.08 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  43.68 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  43.78 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  43.17 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  42.62 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  40 
 
 		 181 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  43.37 
 
 		 199 aa  154  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  44.85 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  41.15 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  46.24 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  41.33 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  44.62 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  50.3 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  41.33 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  42.86 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  46.3 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  48.02 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  49.09 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  43.08 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  42.05 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  44.56 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  46.49 
 
 		 188 aa  151  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  40.82 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  43.88 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  45.64 
 
 		 194 aa  150  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  47.7 
 
 		 200 aa  150  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  42.78 
 
 		 215 aa  150  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  49.39 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  42.71 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  43.52 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  41.71 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  43.52 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  46.03 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  46.33 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  43.68 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  42.93 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  45.2 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  41.71 
 
 		 204 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  45.76 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0425  LemA family protein  42.05 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  46.95 
 
 		 249 aa  147  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>