More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2746 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.96 
 
 
978 aa  1218    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.16 
 
 
979 aa  1099    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.97 
 
 
978 aa  1215    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  59.1 
 
 
978 aa  1216    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  59.73 
 
 
1012 aa  1239    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.97 
 
 
978 aa  1211    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  59.73 
 
 
979 aa  1242    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  59.07 
 
 
978 aa  1214    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.73 
 
 
979 aa  1241    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  58.97 
 
 
978 aa  1214    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.53 
 
 
979 aa  1237    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.35 
 
 
917 aa  635    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  59.42 
 
 
979 aa  1237    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.44 
 
 
987 aa  1253    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.25 
 
 
986 aa  1283    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.97 
 
 
978 aa  1211    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  59.73 
 
 
979 aa  1242    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.88 
 
 
973 aa  1072    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  37.88 
 
 
899 aa  642    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  59.73 
 
 
979 aa  1242    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.86 
 
 
994 aa  1262    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.18 
 
 
898 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.44 
 
 
980 aa  1217    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 
879 aa  650    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.06 
 
 
985 aa  1212    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.86 
 
 
987 aa  1248    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
1004 aa  2091    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  59.63 
 
 
979 aa  1236    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  59.53 
 
 
979 aa  1238    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.97 
 
 
893 aa  639    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.77 
 
 
984 aa  1210    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.85 
 
 
978 aa  1218    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.77 
 
 
984 aa  1210    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.35 
 
 
980 aa  1202    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.97 
 
 
978 aa  1211    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.66 
 
 
893 aa  640    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.06 
 
 
904 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.76 
 
 
893 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.42 
 
 
886 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.9 
 
 
900 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.87 
 
 
901 aa  598  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.03 
 
 
1130 aa  588  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.99 
 
 
900 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.94 
 
 
920 aa  581  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.73 
 
 
906 aa  570  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.01 
 
 
925 aa  569  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  35.48 
 
 
960 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 
948 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.86 
 
 
1110 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.07 
 
 
984 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.07 
 
 
984 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.66 
 
 
944 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.07 
 
 
984 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.68 
 
 
960 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.07 
 
 
984 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.27 
 
 
959 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.99 
 
 
1111 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.57 
 
 
983 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.7 
 
 
959 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.98 
 
 
905 aa  565  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.48 
 
 
983 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.07 
 
 
984 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.21 
 
 
983 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.99 
 
 
983 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.14 
 
 
988 aa  561  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.21 
 
 
948 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.33 
 
 
973 aa  560  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.59 
 
 
1421 aa  562  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.91 
 
 
960 aa  562  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.48 
 
 
983 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.28 
 
 
959 aa  562  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.07 
 
 
984 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 
979 aa  562  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.6 
 
 
988 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.68 
 
 
967 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.83 
 
 
984 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  35.23 
 
 
957 aa  558  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.84 
 
 
983 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.6 
 
 
988 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.84 
 
 
983 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.82 
 
 
959 aa  557  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.96 
 
 
984 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  34 
 
 
947 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.47 
 
 
969 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.83 
 
 
952 aa  555  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.86 
 
 
982 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.96 
 
 
959 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.48 
 
 
948 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  34.98 
 
 
982 aa  556  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.87 
 
 
929 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.41 
 
 
950 aa  551  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.28 
 
 
989 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.82 
 
 
1425 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.28 
 
 
989 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.58 
 
 
948 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.37 
 
 
924 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.28 
 
 
754 aa  550  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.49 
 
 
956 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.45 
 
 
937 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.8 
 
 
959 aa  548  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>