39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4531 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4531  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 788 aa  1610    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4333  FG-GAP repeat protein  36.72 
 
 		 758 aa  364  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00966426  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  26.27 
 
 		 758 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  31.15 
 
 		 8871 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  25.26 
 
 		 768 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1754  FG-GAP repeat-containing protein  23.75 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113998  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 		 1282 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  26.27 
 
 		 1838 aa  61.2  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1756  FG-GAP repeat-containing protein  28.99 
 
 		 708 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000241186  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.43 
 
 		 2194 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  29 
 
 		 577 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  26.67 
 
 		 1129 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.04 
 
 		 1225 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.82 
 
 		 1170 aa  51.2  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  30.2 
 
 		 974 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  31.87 
 
 		 604 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.14 
 
 		 1208 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1757  FG-GAP repeat-containing protein  28.5 
 
 		 730 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000292234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.48 
 
 		 2000 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16659  predicted protein  24.77 
 
 		 742 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0323  hypothetical protein  28.99 
 
 		 503 aa  49.3  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.42 
 
 		 1166 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.82 
 
 		 1340 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.23 
 
 		 1019 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.74 
 
 		 1113 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  23.64 
 
 		 435 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  25.69 
 
 		 562 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1221  FG-GAP repeat-containing protein  28.51 
 
 		 779 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000316782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.01 
 
 		 1114 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.59 
 
 		 437 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  34.15 
 
 		 616 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.61 
 
 		 574 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.82 
 
 		 1222 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  26.87 
 
 		 1172 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  28.32 
 
 		 2474 aa  44.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  32.94 
 
 		 1527 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.64 
 
 		 1490 aa  44.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.24 
 
 		 1226 aa  44.3  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  26.95 
 
 		 491 aa  43.9  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>