More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3896 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3896  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
464 aa  912    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5946  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  65.46 
 
 
467 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4069  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.95 
 
 
457 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  43.22 
 
 
484 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.13 
 
 
484 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42 
 
 
487 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.39 
 
 
484 aa  316  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.91 
 
 
484 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.26 
 
 
457 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000633483  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.57 
 
 
487 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1369  NADH dehydrogenase I chain N  39.22 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0931303  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.3 
 
 
463 aa  289  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.48 
 
 
492 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.14 
 
 
498 aa  272  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.32 
 
 
489 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.89 
 
 
491 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  35.08 
 
 
478 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  40.81 
 
 
527 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2230  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.98 
 
 
498 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.99 
 
 
476 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1531  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.2 
 
 
482 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  35.75 
 
 
478 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  35.07 
 
 
517 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  37.83 
 
 
531 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.84 
 
 
517 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.11 
 
 
478 aa  251  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  35.08 
 
 
481 aa  249  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.15 
 
 
476 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.27 
 
 
497 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.97796  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.84 
 
 
505 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.45 
 
 
483 aa  246  6.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1534  NADH dehydrogenase subunit N  39.29 
 
 
524 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4991  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.6 
 
 
539 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1251  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38 
 
 
500 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.348771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  35.45 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2820  NADH dehydrogenase subunit N  34.69 
 
 
485 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.31 
 
 
482 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2025  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.59 
 
 
514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  35.21 
 
 
482 aa  243  6e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5539  NADH dehydrogenase subunit N  36.82 
 
 
506 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.758308  normal  0.475403 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  39.29 
 
 
524 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  36.74 
 
 
478 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  39.29 
 
 
524 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.93 
 
 
491 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03290  NADH dehydrogenase subunit N  39.64 
 
 
523 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0444  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.93 
 
 
491 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6081  NADH dehydrogenase subunit N  37.14 
 
 
525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.110673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3291  NADH dehydrogenase subunit N  33.19 
 
 
492 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0415  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.93 
 
 
491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5088  NADH dehydrogenase subunit N  40.31 
 
 
506 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  36.44 
 
 
476 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5415  NADH dehydrogenase subunit N  40.1 
 
 
506 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2196  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  37.1 
 
 
520 aa  239  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4972  NADH dehydrogenase subunit N  39.85 
 
 
506 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  34.53 
 
 
490 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  34.53 
 
 
485 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  34.53 
 
 
490 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  37.5 
 
 
475 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  34.53 
 
 
490 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  34.53 
 
 
485 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  34.53 
 
 
485 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5411  NADH dehydrogenase subunit N  36.36 
 
 
506 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  34.53 
 
 
490 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7678  NADH dehydrogenase subunit N  40.65 
 
 
557 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5381  NADH dehydrogenase subunit N  39.85 
 
 
506 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000455286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  34.53 
 
 
485 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  35.66 
 
 
478 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2760  NADH dehydrogenase subunit N  35.15 
 
 
485 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0552  NADH dehydrogenase subunit N  38.1 
 
 
595 aa  237  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5140  NADH dehydrogenase subunit N  39.59 
 
 
506 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5532  NADH dehydrogenase subunit N  39.59 
 
 
506 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5466  NADH dehydrogenase subunit N  39.59 
 
 
506 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  37.44 
 
 
511 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.8 
 
 
513 aa  236  8e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1376  NADH dehydrogenase subunit N  34.19 
 
 
485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0533  NADH dehydrogenase subunit N  39.43 
 
 
533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1381  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.19 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2569  NADH dehydrogenase subunit N  34.19 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.29 
 
 
489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2425  NADH dehydrogenase subunit N  34.19 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2153  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  36.68 
 
 
520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.547893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  34.38 
 
 
489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3415  NADH dehydrogenase subunit N  34.19 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.684658  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.98 
 
 
511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2430  NADH dehydrogenase subunit N  34.19 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0971  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.95 
 
 
511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  37.81 
 
 
479 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3181  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.38 
 
 
489 aa  234  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1951  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.55 
 
 
481 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172883  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  33.57 
 
 
492 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2652  NADH dehydrogenase subunit N  33.98 
 
 
485 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0482  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.53 
 
 
577 aa  233  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.23 
 
 
479 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3216  NADH dehydrogenase subunit N  42.27 
 
 
531 aa  233  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0912532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28560  NADH dehydrogenase subunit N  37.22 
 
 
490 aa  232  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
488 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
488 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  33.81 
 
 
488 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1504  NADH dehydrogenase subunit N  36.03 
 
 
485 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  34.05 
 
 
488 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>