More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2612 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2612  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 395 aa  816    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  76.96 
 
 		 402 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  57.14 
 
 		 391 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  59.17 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  55.24 
 
 		 390 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  53.14 
 
 		 388 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.26 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.96 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.7 
 
 		 410 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.32 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.06 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.61 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.16 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.17 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.17 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.1 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.16 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.55 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.35 
 
 		 392 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.55 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.19 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.55 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.09 
 
 		 402 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.49 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.16 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.16 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.12 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.16 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.79 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.16 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.44 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.16 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  48.57 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.96 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.91 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.39 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.91 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.93 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.91 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.83 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.24 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.77 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.79 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  45.6 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.62 
 
 		 402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.98 
 
 		 403 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.95 
 
 		 419 aa  362  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.72 
 
 		 397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  45.34 
 
 		 414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.43 
 
 		 402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.62 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.11 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.75 
 
 		 391 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.81 
 
 		 417 aa  359  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.37 
 
 		 408 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.6 
 
 		 397 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  43.26 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.99 
 
 		 408 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.86 
 
 		 406 aa  355  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 		 403 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.94 
 
 		 410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.41 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.52 
 
 		 399 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.41 
 
 		 407 aa  352  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.64 
 
 		 404 aa  352  8.999999999999999e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.31 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.31 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.34 
 
 		 422 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.83 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.78 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.96 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.36 
 
 		 413 aa  349  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.88 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.94 
 
 		 406 aa  348  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.65 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.08 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.56 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.78 
 
 		 394 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.38 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.45 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.93 
 
 		 397 aa  345  8e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.81 
 
 		 393 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.53 
 
 		 403 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.26 
 
 		 412 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.81 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.75 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.26 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.22 
 
 		 408 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.26 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.78 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.21 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.62 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  44.5 
 
 		 401 aa  342  5.999999999999999e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.67 
 
 		 407 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3120  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.86 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.53 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1661  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.04 
 
 		 394 aa  339  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>