More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2520 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2520  sulfatase  100 
 
 
607 aa  1245    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541987  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1566  sulfatase  43.22 
 
 
630 aa  459  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2626  sulfatase  42.15 
 
 
624 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5209  sulfatase  41.81 
 
 
603 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5650  sulfatase  41.81 
 
 
603 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.372268  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2367  sulfatase family protein  36.72 
 
 
558 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0762  sulfatase  36.55 
 
 
576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.378263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3657  sulfatase  32.19 
 
 
494 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000376885  normal  0.0602445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  33.98 
 
 
486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2826  sulfatase  31.47 
 
 
500 aa  185  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.250394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  31.43 
 
 
481 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  27.09 
 
 
554 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  27.69 
 
 
614 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3336  sulfatase  29.07 
 
 
482 aa  153  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.990519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  26.76 
 
 
514 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  30.17 
 
 
465 aa  143  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0390  sulfatase  28.92 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0399  sulfatase  28.92 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0378  sulfatase  28.92 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0510065  normal  0.447114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1562  sulfatase  28.7 
 
 
477 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  26.8 
 
 
431 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2349  sulfatase  27.29 
 
 
437 aa  137  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0122  sulfatase  26.98 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  23.99 
 
 
535 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1723  sulfatase  26.86 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3825  sulfatase  24.44 
 
 
451 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3375  sulfatase  25.05 
 
 
474 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  24.22 
 
 
537 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  24.18 
 
 
518 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  25.69 
 
 
511 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  25.55 
 
 
523 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  24.85 
 
 
449 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  25.96 
 
 
564 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  23.49 
 
 
486 aa  101  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0798  sulfatase  23.39 
 
 
518 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0822937  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0706  sulfatase  24.02 
 
 
576 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  23.2 
 
 
479 aa  100  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3398  sulfatase  25 
 
 
524 aa  99.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.145395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  25.53 
 
 
497 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  25.54 
 
 
559 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  24.08 
 
 
452 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  24.67 
 
 
522 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  24.53 
 
 
485 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  24.34 
 
 
501 aa  95.1  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  26.27 
 
 
621 aa  94.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  24.6 
 
 
482 aa  94.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2825  sulfatase  22.13 
 
 
464 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.424556  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  28.65 
 
 
466 aa  94.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  24.76 
 
 
478 aa  94.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  24.35 
 
 
483 aa  94.4  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  27.68 
 
 
482 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  23.17 
 
 
492 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  23.84 
 
 
535 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  26.59 
 
 
459 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  23.84 
 
 
535 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  29 
 
 
520 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  25.82 
 
 
453 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  24.06 
 
 
535 aa  91.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  21.46 
 
 
489 aa  90.5  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  25.21 
 
 
489 aa  90.5  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  23.94 
 
 
513 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  23.12 
 
 
503 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  25 
 
 
453 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  23.81 
 
 
511 aa  87.8  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  25.89 
 
 
497 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5375  sulfatase  28.81 
 
 
560 aa  87.8  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  29.25 
 
 
549 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  24.68 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  26.35 
 
 
479 aa  84.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  26.52 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  23.71 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  27.41 
 
 
537 aa  84.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  25.25 
 
 
486 aa  83.2  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  24.64 
 
 
453 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  26.84 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  28.33 
 
 
545 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  25 
 
 
487 aa  82  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  25.22 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  24.32 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  24.18 
 
 
503 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  28 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  24.46 
 
 
481 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  22.44 
 
 
489 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26.4 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  24.46 
 
 
487 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  36.73 
 
 
586 aa  79  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  22.86 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  25.98 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  23.53 
 
 
502 aa  78.2  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  27.13 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.8 
 
 
526 aa  77  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  23.37 
 
 
513 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2610  sulfatase  23.7 
 
 
477 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000218719  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  24.29 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  35 
 
 
511 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  23.98 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  26.56 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  22.73 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  23.41 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  23.18 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>