More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1130 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  100 
 
 
537 aa  1121    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  45.82 
 
 
474 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  45.96 
 
 
478 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  45.73 
 
 
483 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  41.86 
 
 
545 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  44.8 
 
 
515 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  41.75 
 
 
511 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  42.74 
 
 
526 aa  362  7.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  39.84 
 
 
522 aa  349  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  40.97 
 
 
520 aa  349  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  40 
 
 
523 aa  349  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5375  sulfatase  38.75 
 
 
560 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  38.28 
 
 
511 aa  339  7e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1074  sulfatase  38.25 
 
 
552 aa  339  9e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0111181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  38.94 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  36.26 
 
 
549 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1033  sulfatase  35.5 
 
 
581 aa  298  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  30.46 
 
 
537 aa  226  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  30.54 
 
 
559 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  30.25 
 
 
564 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  30.14 
 
 
485 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.08 
 
 
526 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2610  sulfatase  27.66 
 
 
477 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000218719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  26.82 
 
 
536 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  26.82 
 
 
536 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  28.85 
 
 
453 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  24.51 
 
 
536 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  26.78 
 
 
542 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  27.45 
 
 
508 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0054  sulfatase  27.98 
 
 
461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  24.82 
 
 
533 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  25.59 
 
 
501 aa  134  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  26.26 
 
 
551 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7372  N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.76 
 
 
513 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.834841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  26.05 
 
 
535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  28.46 
 
 
493 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  25.67 
 
 
486 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  26.13 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  24.33 
 
 
499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  26.68 
 
 
478 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  25.91 
 
 
503 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  25.57 
 
 
586 aa  130  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  25.14 
 
 
553 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  24.68 
 
 
473 aa  127  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4926  sulfatase  26.89 
 
 
534 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  25.94 
 
 
514 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  24.91 
 
 
520 aa  126  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  26.32 
 
 
498 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  25.33 
 
 
518 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  24.47 
 
 
511 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  25.04 
 
 
581 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  24.13 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  24.37 
 
 
582 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  25.93 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  27.49 
 
 
542 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  25.71 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  23.45 
 
 
543 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  23.46 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  24.18 
 
 
447 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  26.06 
 
 
514 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  24.9 
 
 
502 aa  117  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  25.04 
 
 
563 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  23.44 
 
 
505 aa  115  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  24.91 
 
 
584 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  24.12 
 
 
502 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  24.91 
 
 
519 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25.19 
 
 
508 aa  114  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  23.71 
 
 
578 aa  113  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  22.76 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  23.83 
 
 
616 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  26.91 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  35.53 
 
 
457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  23.77 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  24.51 
 
 
620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  22.95 
 
 
481 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  24.19 
 
 
519 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2189  sulfatase  23.99 
 
 
524 aa  110  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.2172  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  25.75 
 
 
513 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  25.71 
 
 
489 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  34.33 
 
 
492 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37138  Arylsulfatase (AS) (Aryl-sulfate sulphohydrolase)  24.21 
 
 
565 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.218235  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5423  arylsulfatase  22.66 
 
 
660 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.634686  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  24.04 
 
 
505 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  21.72 
 
 
480 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  23.4 
 
 
541 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  24.73 
 
 
772 aa  107  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  25.6 
 
 
499 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  23.98 
 
 
504 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11149  conserved hypothetical protein  25.39 
 
 
565 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122121  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  35.71 
 
 
482 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  24.29 
 
 
496 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2068  sulfatase  26.05 
 
 
491 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  24.5 
 
 
496 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2363  sulfatase  24.7 
 
 
783 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  34.98 
 
 
462 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  25.67 
 
 
766 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  24.13 
 
 
505 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  31.58 
 
 
465 aa  104  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  34.34 
 
 
517 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  32.51 
 
 
442 aa  104  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>