More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2068 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2068  sulfatase  100 
 
 		 491 aa  1019    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300653 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6093  sulfatase  47.37 
 
 		 505 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0958  sulfatase  48.97 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0959773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1020  sulfatase  48.74 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0923  sulfatase  48.97 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1039  sulfatase  48.74 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0990  sulfatase  48.28 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0130  sulfatase  46.12 
 
 		 501 aa  422  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2095  sulfatase  44.68 
 
 		 594 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1018  sulfatase  47.6 
 
 		 493 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1530  sulfatase  45.18 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3271  sulfatase  44.24 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755541  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3137  sulfatase  41.3 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.738751 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6791  sulfatase  37.29 
 
 		 497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0934  sulfatase  35.4 
 
 		 518 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2686  twin-arginine translocation pathway signal  32.98 
 
 		 490 aa  170  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1235  sulfatase  32.63 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0770  sulfatase  29.53 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.119074  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  29.34 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0462  sulfatase, putative  29.81 
 
 		 520 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2553  sulfatase  28.44 
 
 		 520 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1201  sulfatase, putative  28.07 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.68416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4747  sulfatase  25.94 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.833748  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  25.44 
 
 		 474 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5751  sulfatase  28.12 
 
 		 512 aa  123  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1305  sulfatase  27.49 
 
 		 491 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  26.02 
 
 		 497 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  26.12 
 
 		 518 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  25.45 
 
 		 526 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  26.18 
 
 		 523 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  27.99 
 
 		 535 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  26.61 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  26.15 
 
 		 554 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  25.94 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  24.63 
 
 		 508 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  26.12 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2061  sulfatase  26.33 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  25.19 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1013  sulfatase  25.31 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  25.55 
 
 		 526 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  23.4 
 
 		 511 aa  100  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  26.29 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  26.16 
 
 		 502 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  25.24 
 
 		 572 aa  97.1  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  26.62 
 
 		 505 aa  97.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  22.89 
 
 		 481 aa  96.7  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  23.31 
 
 		 509 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  22.12 
 
 		 535 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0528  sulfatase  25 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  24.7 
 
 		 536 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  23.98 
 
 		 496 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  23.74 
 
 		 586 aa  93.6  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  24.68 
 
 		 480 aa  93.2  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  23.58 
 
 		 519 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  25.34 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3641  sulfatase  25.52 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5750  sulfatase  24.13 
 
 		 505 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  25.53 
 
 		 486 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3519  sulfatase  23.74 
 
 		 545 aa  90.9  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  24.51 
 
 		 493 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  24.2 
 
 		 491 aa  90.1  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  23.56 
 
 		 501 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  25.36 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  26.92 
 
 		 494 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  26.04 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  27.75 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  23.57 
 
 		 499 aa  87.4  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  23.43 
 
 		 501 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  25.71 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  22.15 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  24.44 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  22.28 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  24.37 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  23.53 
 
 		 502 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  21.81 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  23.33 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  23.65 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  24.69 
 
 		 497 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  27.67 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  25.24 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  23.65 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  25.48 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  24.32 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  37.82 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1101  sulfatase family protein  21.63 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00123552  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  23.72 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  26.56 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  26.56 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  26.56 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  24.26 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  24.71 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  24.71 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  24.71 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  24.71 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  24.71 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  24.71 
 
 		 522 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  26.12 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  26.54 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  23.31 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0054  sulfatase  26.32 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>