103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0432 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 292 aa  607  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  44.76 
 
 		 288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4447  Aldose 1-epimerase  42.56 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  39.59 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  39.59 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  39.18 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  39.38 
 
 		 290 aa  211  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  39.66 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  36.64 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  36.99 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  36.3 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  36.64 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  36.64 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  36.64 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  36.3 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  36.3 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  36.3 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  36.3 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  35.74 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  37.88 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  34.84 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  30.95 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  33.68 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  33.44 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  33.68 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D38  galactose mutarotase-like protein  34.24 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  33.91 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  33.21 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1924  Aldose 1-epimerase  32.76 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.532522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2535  aldose 1-epimerase  31.77 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1529  Aldose 1-epimerase  28.47 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  30.3 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  31.07 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  28.77 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  30.22 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3188  aldose 1-epimerase  32.68 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301236 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  30.27 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  32 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  31.64 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  32.62 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0246  Aldose 1-epimerase  32.5 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  31.06 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  29.93 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  30.68 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  30.33 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3295  Aldose 1-epimerase protein  29.17 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0645  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.148137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1177  galactose mutarotase-like protein  28.91 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1883  Aldose 1-epimerase  28.21 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  27.31 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  26.1 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  26.1 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  27.31 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  30.84 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  26.83 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  25.85 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  28.74 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  23.58 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  25.57 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  25.57 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  23.61 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  24.3 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  23.51 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  23.51 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  23.85 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  24.92 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  25.33 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5126  hypothetical protein  34.09 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  27.16 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  24.7 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  30.39 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  25.71 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  26.47 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  22.77 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  23.25 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  22.77 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  22.77 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  23.27 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  23.53 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  24.6 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  23.24 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  24.42 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  23.62 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  25.24 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  25.44 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  22.03 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  23.64 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  23.69 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  23.28 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  23.72 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  22.49 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2081  hypothetical protein  22.15 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.47 
 
 		 312 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3194  aldose 1-epimerase  29.73 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0888989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  23.44 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  24.31 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  30.28 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1820  hypothetical protein  22.78 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00406664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  29.08 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>