34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0402 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  528  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  88.37 
 
 		 258 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  87.21 
 
 		 258 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  32.08 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.58 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.22 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.14 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.18 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  30.45 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.73 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  28.09 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 796 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  28.85 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.48 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  23.83 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.53 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.63 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 		 322 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  28.67 
 
 		 397 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 309 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.48 
 
 		 339 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 821 aa  42  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>