More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0989 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  36.95 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.98 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  40.59 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  36.69 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2149  ABC transporter related  37.7 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.161407 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  35.48 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.59 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  35.78 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  36 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  37.86 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  34.91 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  34.68 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  37.45 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  38.79 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  34.48 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  35.04 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  34.05 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  34.54 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  38.15 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  34.91 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  41.9 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  35.89 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  36.55 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  40.94 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  38.89 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  37.7 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  36.16 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  37.61 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  37.99 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0814  ABC transporter related protein  36.95 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  39.09 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  36.36 
 
 		 258 aa  154  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  37.3 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  34.98 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  39.46 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  39.52 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  39.52 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  37.39 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  39.84 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  40.29 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  38.14 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  40.42 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  35.19 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1710  ABC transporter related  31.87 
 
 		 236 aa  148  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  37.25 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  38.43 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  36.63 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  37.66 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  35.42 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  36.68 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2772  ABC transporter related  40 
 
 		 289 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  32.79 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.3 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  37.4 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2524  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  38.91 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  38.68 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.89 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  38.91 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  39.76 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  38.33 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  34.43 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  39.66 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  34.25 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.04 
 
 		 271 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  39.59 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 296 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  38.1 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  39.83 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0214  ABC transporter related  37.89 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.387521  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.83 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1908  ABC transporter related  38.43 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  35.22 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  36.25 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  37.11 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  37.61 
 
 		 290 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>