60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0796 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  60.36 
 
 		 284 aa  345  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  61.62 
 
 		 294 aa  338  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  59.78 
 
 		 282 aa  319  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  49.08 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  35.27 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  37.96 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  38.52 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  33.45 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  36.26 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  37.09 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  35.23 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  34.8 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  34.07 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  35.32 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  37.45 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  38.3 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  32.86 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  35.93 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  32.72 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  37.16 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  34.63 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  31.16 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  33.22 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  32.23 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  37.35 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  37.35 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  34.95 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  34.87 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  29.86 
 
 		 500 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  32.57 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  29.01 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  28.31 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  32.03 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  31.06 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  27.99 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  24.26 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 626 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  29.84 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  31.16 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 625 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  25 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  26.1 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  23.14 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  24.51 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  23.64 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  29.44 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  26.07 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  25.67 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  23.05 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  23.64 
 
 		 280 aa  49.3  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  28.43 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  25.97 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  23.81 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0224  hypothetical protein  24.46 
 
 		 239 aa  42.4  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.418253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>