More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3748 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  79.33 
 
 
387 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  79.33 
 
 
387 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.59 
 
 
387 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.59 
 
 
387 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.07 
 
 
387 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.59 
 
 
387 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.07 
 
 
387 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.81 
 
 
387 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.84 
 
 
387 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  83.72 
 
 
387 aa  665    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.55 
 
 
387 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  79.33 
 
 
387 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.07 
 
 
387 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 
387 aa  781    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.81 
 
 
387 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  79.07 
 
 
387 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  80.62 
 
 
387 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  80.1 
 
 
387 aa  643    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.04 
 
 
387 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.04 
 
 
387 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  78.04 
 
 
387 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.26 
 
 
387 aa  627  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.26 
 
 
387 aa  627  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.88 
 
 
391 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.54 
 
 
387 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.21 
 
 
387 aa  567  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.95 
 
 
387 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.95 
 
 
387 aa  564  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.73 
 
 
387 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.51 
 
 
387 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.03 
 
 
387 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.28 
 
 
387 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.03 
 
 
387 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00459  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.92 
 
 
374 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.25 
 
 
387 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.25 
 
 
387 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.65 
 
 
387 aa  557  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.25 
 
 
387 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.25 
 
 
387 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.51 
 
 
387 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.51 
 
 
387 aa  555  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.25 
 
 
387 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.25 
 
 
387 aa  551  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0202  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.37 
 
 
386 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0146484  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.57 
 
 
387 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.6 
 
 
386 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.66 
 
 
391 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.77 
 
 
391 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.14 
 
 
391 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.14 
 
 
391 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  60.84 
 
 
391 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  60.84 
 
 
391 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.62 
 
 
391 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.62 
 
 
391 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.62 
 
 
391 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.88 
 
 
391 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2099  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.4 
 
 
390 aa  482  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  60.68 
 
 
391 aa  481  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.14 
 
 
391 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.19 
 
 
391 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  64.49 
 
 
391 aa  474  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2392  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.14 
 
 
392 aa  474  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  59.84 
 
 
390 aa  472  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  59.84 
 
 
390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  49.51 
 
 
398 aa  359  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  50.62 
 
 
403 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  48.77 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  50.62 
 
 
402 aa  351  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  49.01 
 
 
400 aa  347  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  47.9 
 
 
399 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
390 aa  345  7e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  47.64 
 
 
401 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.75 
 
 
402 aa  342  9e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 
402 aa  341  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.27 
 
 
401 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.27 
 
 
401 aa  332  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.27 
 
 
401 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.27 
 
 
401 aa  332  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 
390 aa  332  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.11 
 
 
424 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  47.67 
 
 
402 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
394 aa  330  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
390 aa  329  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.35 
 
 
400 aa  329  6e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
390 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.44 
 
 
412 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  49.21 
 
 
391 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  48.82 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 
390 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
390 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
390 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
390 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
390 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
390 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
390 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.09 
 
 
391 aa  322  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.42 
 
 
404 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>