More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2125 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2125  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 321 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.438964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3388  peptidase M48, Ste24p  52.12 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.580717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  51.14 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3419  M48 family peptidase  52.82 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  52.46 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1109  peptidase M48 Ste24p  48.07 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1572  peptidase M48, Ste24p  45.62 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0369731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0615  peptidase M48 Ste24p  51.76 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.456221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1189  M48 family peptidase  40.95 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2161  M48 family peptidase  46.06 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2025  peptidase M48, Ste24p  41.84 
 
 		 331 aa  195  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2090  peptidase, M48 family  40.75 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.750108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1746  peptidase M48 Ste24p  40.75 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0403814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1347  peptidase M48, Ste24p  41.49 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0550  peptidase M48, Ste24p  45.74 
 
 		 320 aa  185  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111224  hitchhiker  0.000685089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  35.07 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  33.8 
 
 		 285 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  34.84 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  33.8 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  34.04 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  33.68 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  34.49 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  33.8 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  33.79 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  33.11 
 
 		 286 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  33.45 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  35.95 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  31.82 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  35.92 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  33.57 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  32.63 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  33.79 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  33.45 
 
 		 280 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  34.49 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  34.28 
 
 		 287 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  38.46 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  35.42 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  32.87 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  32.51 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  33.8 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  33.68 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  31.13 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  32.29 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  32.61 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  32.74 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  35.49 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  34.81 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  32.03 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  33.68 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  35.19 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  33.57 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  33.55 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  31.63 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1860  peptidase M48 Ste24p  35.47 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  33.68 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  33.45 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  33.8 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  34.16 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  33.58 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1945  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685786  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  33.57 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  33.09 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  34.43 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  34.48 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  34.38 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  32.87 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  35.19 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  34.1 
 
 		 285 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  35.42 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  36.02 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  32 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  33.93 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  34.95 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  34.38 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  30.74 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  32.04 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  33.81 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  35.14 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  34.15 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0401  M48 family peptidase  32.65 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000207602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  33.21 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  30.07 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  31.9 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  31.9 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>