83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0403 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  48.94 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1579  DNA binding domain protein, excisionase family  45.9 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.963252  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  42.55 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 248 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1410  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  50 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.251698  normal  0.111999 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0602  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  34.92 
 
 		 335 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  44.44 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0294  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0165265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  42.22 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  45.65 
 
 		 306 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  42.22 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  42.22 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  43.48 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  43.48 
 
 		 315 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  39.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  38.78 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  45.65 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  43.48 
 
 		 315 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  43.48 
 
 		 306 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  43.48 
 
 		 306 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  43.48 
 
 		 306 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  43.48 
 
 		 315 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  36.92 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  43.4 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  36.73 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  38.78 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1745  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  39.06 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  45.65 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  36.92 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  40.91 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  43.48 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  36 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  43.4 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  37.78 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  20.54 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 90 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  28.09 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  35.85 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  40.43 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  43.59 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  35.85 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  43.59 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  33.85 
 
 		 73 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  40 
 
 		 317 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 		 59 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>