More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0342 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
417 aa  844    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  61.17 
 
 
396 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  63.71 
 
 
402 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  62.88 
 
 
400 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  54.99 
 
 
394 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  56.31 
 
 
396 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  55.75 
 
 
399 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  54.55 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  54.31 
 
 
400 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  54.16 
 
 
399 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  51.77 
 
 
395 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.3 
 
 
395 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  51.52 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  54.91 
 
 
399 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.2 
 
 
399 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  53.96 
 
 
397 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  53.96 
 
 
397 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  55.58 
 
 
396 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.64 
 
 
399 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  50.76 
 
 
395 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.06 
 
 
397 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  50.65 
 
 
394 aa  424  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  47.62 
 
 
396 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  51.81 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  48.87 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  52.07 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  51.41 
 
 
398 aa  411  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  51.81 
 
 
396 aa  408  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  50.5 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.39 
 
 
400 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.23 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  50.66 
 
 
388 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  52.02 
 
 
418 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  47.66 
 
 
385 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  52.09 
 
 
391 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  47.4 
 
 
385 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.46 
 
 
406 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  47.94 
 
 
405 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.2 
 
 
405 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  49.61 
 
 
390 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.43 
 
 
406 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.93 
 
 
406 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.21 
 
 
413 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.62 
 
 
403 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.41 
 
 
406 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.66 
 
 
406 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.78 
 
 
406 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
392 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.92 
 
 
408 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  46.75 
 
 
403 aa  365  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.34 
 
 
406 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
386 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  49.11 
 
 
427 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  48.81 
 
 
402 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  48.23 
 
 
397 aa  363  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  48.09 
 
 
423 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  46.65 
 
 
418 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  47 
 
 
418 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.81 
 
 
427 aa  363  5.0000000000000005e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.82 
 
 
406 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.9 
 
 
405 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.9 
 
 
405 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.9 
 
 
405 aa  362  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  47.93 
 
 
401 aa  362  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.41 
 
 
408 aa  362  6e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  50.54 
 
 
399 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  48.58 
 
 
380 aa  360  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.92 
 
 
402 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.15 
 
 
394 aa  359  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  50.77 
 
 
422 aa  359  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  47.96 
 
 
404 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  46.58 
 
 
426 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  49.6 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.22 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  50.52 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  47.19 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.11 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  44.19 
 
 
390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.43 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  50.27 
 
 
401 aa  356  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.88 
 
 
406 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  51.33 
 
 
405 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.53 
 
 
385 aa  355  6.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3836  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.86 
 
 
405 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  51.54 
 
 
394 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.36 
 
 
405 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  51.74 
 
 
394 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  51.35 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4669  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.86 
 
 
406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160127  normal  0.232002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0353  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.86 
 
 
406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  51.17 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03210  bifunctional acetylornithine aminotransferase/ succinyldiaminopimelate aminotransferase  43.86 
 
 
406 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.411441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0353  succinylornithine transaminase family  43.86 
 
 
406 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.124803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03162  hypothetical protein  43.86 
 
 
406 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  48.8 
 
 
391 aa  353  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
398 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3786  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.57 
 
 
411 aa  353  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742991  hitchhiker  0.00618312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  48.2 
 
 
388 aa  352  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  49.49 
 
 
403 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>