219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3550 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
278 aa  535  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  32.11 
 
 
812 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.18 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.96 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  37.43 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.41 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.96 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.42 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.97 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.58 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.79 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  41.18 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.77 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.29 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  39.67 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.67 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
178 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.15 
 
 
182 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.61 
 
 
198 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  33.93 
 
 
219 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.59 
 
 
182 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.34 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  31.56 
 
 
438 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.56 
 
 
438 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 
359 aa  55.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  42.11 
 
 
359 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.46 
 
 
178 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.46 
 
 
178 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.97 
 
 
176 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  29.66 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  28.97 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  28.97 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 
174 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.7 
 
 
188 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  29.66 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  29.66 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.83 
 
 
185 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  28.97 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.78 
 
 
208 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.71 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.71 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.91 
 
 
194 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  28.97 
 
 
177 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  28.97 
 
 
177 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  28.97 
 
 
177 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.54 
 
 
166 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
183 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.25 
 
 
438 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  30.07 
 
 
175 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  37.39 
 
 
138 aa  52.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.37 
 
 
201 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.37 
 
 
201 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  35.54 
 
 
438 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  44.19 
 
 
357 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  33 
 
 
217 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.03 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.9 
 
 
177 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  47.37 
 
 
199 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.54 
 
 
438 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.94 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.54 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.51 
 
 
179 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.86 
 
 
204 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  36.78 
 
 
445 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0079  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.53 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  39.56 
 
 
358 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.86 
 
 
157 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.93 
 
 
197 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.57 
 
 
438 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  27.1 
 
 
185 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.42 
 
 
182 aa  48.9  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.82 
 
 
244 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.28 
 
 
230 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  35.79 
 
 
199 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.29 
 
 
465 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  33.91 
 
 
187 aa  48.9  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.58 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.44 
 
 
425 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.25 
 
 
182 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.91 
 
 
431 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.73 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  31.25 
 
 
174 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.06 
 
 
211 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.9 
 
 
172 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  30.77 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.92 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.93 
 
 
199 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  38.06 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.55 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  36.84 
 
 
199 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  43.04 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  38 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  31.63 
 
 
187 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.39 
 
 
207 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.77 
 
 
208 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.69 
 
 
176 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>