More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5863 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5863  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2078  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.571486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1636  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  47.75 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  50.83 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 		 260 aa  77  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  34.86 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  44.25 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  41.53 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  40.71 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  37.21 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  39.13 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  32.77 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.62 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  35.14 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  35.14 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  29.1 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  32.52 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  32.52 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  32.81 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1351  LysR, substrate-binding  49.25 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  35.59 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  35.29 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  34.45 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3521  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  29.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  33.06 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  32.23 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  33.91 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.03 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  29.92 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  32.76 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  28.89 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  31.67 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  28.89 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  28.89 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  30.58 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>