42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5142 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  76.51 
 
 		 432 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  74.77 
 
 		 431 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  75.46 
 
 		 436 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  879    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  76.24 
 
 		 445 aa  705    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  75.93 
 
 		 431 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  76.39 
 
 		 431 aa  698    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  66.82 
 
 		 449 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  66.07 
 
 		 448 aa  621  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  62.7 
 
 		 423 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  59.27 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  59.16 
 
 		 434 aa  541  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  61.87 
 
 		 441 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  59.45 
 
 		 443 aa  531  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  56.09 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  52.66 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  43.18 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  39.9 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  38.71 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  37.53 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  39.13 
 
 		 442 aa  312  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  38.04 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  44.17 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  34.12 
 
 		 433 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  32.61 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  25.93 
 
 		 435 aa  123  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  26.58 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  24.68 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  29.51 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  26.84 
 
 		 441 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  26.13 
 
 		 442 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  27.97 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  24.81 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  25 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  25.56 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  27.48 
 
 		 444 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  25.13 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  27.1 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  26.48 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  23.15 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  24.44 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 981 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>