35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3217 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  39.24 
 
 		 421 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  41.09 
 
 		 331 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  39.84 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  31.32 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  33.81 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  35.77 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  36.63 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  27.52 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  37.62 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  30.95 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  35.64 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.08 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  32.08 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  32.08 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  32.67 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  27.34 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  40.3 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  38.75 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  28.3 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  30.77 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  31.13 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  32.74 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  31.5 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  34.65 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  31.5 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  31.5 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  33.86 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  28.28 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  30.37 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  30.88 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  26.71 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>