33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0903 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  933    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  38.29 
 
 		 447 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3613  HipA domain protein  36.26 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  35.92 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4855  hypothetical protein  40.09 
 
 		 452 aa  227  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.874241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1570  hypothetical protein  38.05 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2168  hypothetical protein  39.26 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3571  hypothetical protein  37.07 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4986  hypothetical protein  35.62 
 
 		 319 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  29.32 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  27.75 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  26.05 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  27.08 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  27.6 
 
 		 415 aa  54.7  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  28.8 
 
 		 407 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  24.88 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  26.42 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  25.49 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  29.15 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  27.23 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  28.7 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  28.7 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  29.23 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  28.04 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  27 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  25.7 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  26.09 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  32.2 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  33.9 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  26.84 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 453 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  27.39 
 
 		 409 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  24.48 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>