282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0592 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  100 
 
 
319 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.96 
 
 
311 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  53.43 
 
 
331 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.11 
 
 
310 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  54.09 
 
 
318 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.92 
 
 
294 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.53 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.57 
 
 
291 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.36 
 
 
278 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.88 
 
 
285 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.28 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.32 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.72 
 
 
280 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.68 
 
 
279 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.4 
 
 
276 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  46.01 
 
 
280 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.37 
 
 
280 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.25 
 
 
273 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.87 
 
 
280 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  46.95 
 
 
278 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  47.1 
 
 
278 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  47.42 
 
 
278 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.79 
 
 
279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.28 
 
 
276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.28 
 
 
279 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.78 
 
 
279 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.63 
 
 
283 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.44 
 
 
281 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.13 
 
 
340 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.44 
 
 
281 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.06 
 
 
304 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.81 
 
 
278 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.14 
 
 
294 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.14 
 
 
294 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.93 
 
 
239 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.81 
 
 
294 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.54 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.48 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.68 
 
 
292 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.38 
 
 
293 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.37 
 
 
292 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.37 
 
 
292 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.55 
 
 
293 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  42.49 
 
 
298 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  38.01 
 
 
292 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.71 
 
 
276 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.58 
 
 
293 aa  188  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.77 
 
 
299 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  41.77 
 
 
299 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.77 
 
 
299 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  41.77 
 
 
299 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.77 
 
 
299 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  41.77 
 
 
299 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  41.77 
 
 
299 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40 
 
 
298 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  40.12 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.13 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.22 
 
 
292 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.38 
 
 
293 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.27 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.77 
 
 
305 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.68 
 
 
296 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  38.12 
 
 
290 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  33.85 
 
 
296 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.51 
 
 
292 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  33.33 
 
 
293 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.39 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.07 
 
 
305 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.18 
 
 
286 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.18 
 
 
286 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.86 
 
 
286 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.81 
 
 
289 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.06 
 
 
278 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.82 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  33.76 
 
 
285 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.94 
 
 
309 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.73 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.94 
 
 
309 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.88 
 
 
288 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  34.67 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.94 
 
 
309 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.99 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.43 
 
 
285 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.28 
 
 
304 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.65 
 
 
288 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.5 
 
 
299 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  64.29 
 
 
304 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.21 
 
 
279 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  31.86 
 
 
278 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  31.86 
 
 
278 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  31.53 
 
 
278 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  31.53 
 
 
278 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  30.65 
 
 
285 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.56 
 
 
302 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.82 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1571  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.75 
 
 
301 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0651905  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.29 
 
 
313 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.29 
 
 
313 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  61.9 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>