37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0517 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  211  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.95 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  37.8 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  35.71 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  35.96 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  34.58 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  33.03 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  33.72 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  35.37 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.38 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  32.11 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.888659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  35.9 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  29.63 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.5 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  30.99 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.3 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  35.06 
 
 		 127 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 123 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  26.58 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.63 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.63 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 104 aa  40  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>