41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1003 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  665    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  78.15 
 
 		 329 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  77.23 
 
 		 329 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.58 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3792  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)  29.56 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  23.58 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  22.32 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  24.73 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.92 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.92 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.24 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  28.31 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  23.84 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  22.8 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  24.56 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  24.64 
 
 		 550 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 		 689 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2913  hypothetical protein  24.69 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  23.1 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3241  hypothetical protein  25.13 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.16 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  25.51 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 690 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  25.63 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 690 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20 
 
 		 359 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5003  hypothetical protein  24.54 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.403885  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  26.56 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  23.56 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1858  hypothetical protein  28.07 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  23.19 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2517  hypothetical protein  23.46 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  23.68 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.82 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.07 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  25.83 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.19 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5313  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.54 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>