243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1063 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  100 
 
 
164 aa  321  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  43.33 
 
 
168 aa  127  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  48.25 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  39.51 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  41.3 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  40.24 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  36.97 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  34.03 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  35.43 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  32.88 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  33.09 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  32.52 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  32.52 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  31.25 
 
 
191 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  29.33 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  29.33 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  34.43 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  33.58 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  32.92 
 
 
175 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  22.3 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  25.33 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  34.68 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  34.68 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  27.73 
 
 
148 aa  55.1  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.17 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.17 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  26.15 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  33.33 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  27.04 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  27.04 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  27.42 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  24.19 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  27.04 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  25.69 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  29.17 
 
 
154 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  26.45 
 
 
148 aa  52  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  26.45 
 
 
151 aa  52  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  28.81 
 
 
154 aa  52  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  26.42 
 
 
165 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  23.39 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  25.56 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  25.19 
 
 
174 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.81 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  22.79 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  29.61 
 
 
187 aa  51.2  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  23.39 
 
 
170 aa  51.2  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  32.41 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  21.66 
 
 
168 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  26.67 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  24.43 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  24.19 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  24.19 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  25.17 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  22.58 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  27.81 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  22.22 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  27.5 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  28.17 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  26.61 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  23.39 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  24.03 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  24.24 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  29.11 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  26.17 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  28.83 
 
 
181 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.4 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  29.81 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  22.31 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  22.31 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  26.25 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  25 
 
 
218 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  25.76 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.39 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  25.81 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  22.31 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  22.31 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  22.31 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  22.31 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  22.31 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  21.77 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.4 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  25.81 
 
 
160 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  27.33 
 
 
205 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  23.4 
 
 
168 aa  47.4  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  21.77 
 
 
159 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  26.95 
 
 
185 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  22.58 
 
 
163 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  25.42 
 
 
141 aa  47.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.58 
 
 
159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  25.38 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  23.66 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  22.58 
 
 
159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  22.58 
 
 
159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  29.91 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  27.69 
 
 
344 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  24.59 
 
 
149 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  22.58 
 
 
159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  23.29 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  29.91 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  29.66 
 
 
140 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>