95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0049 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0011  tRNA-Arg  94.34 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.264666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0032  tRNA-Arg  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513939  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0030  tRNA-Arg  88.33 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.474637  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  88.33 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0005  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20883  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0050  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0046  tRNA-Arg  88.71 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0060  tRNA-Arg  86.36 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0013  tRNA-Arg  87.88 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0051  tRNA-Arg  87.88 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0008  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1415  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0030  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  88.46 
 
 
74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  88.46 
 
 
74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0024  tRNA-Arg  88.46 
 
 
77 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.242795  normal  0.395578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0046  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna24  tRNA-Arg  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0064  tRNA-Arg  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04240  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0053  tRNA-Arg  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673095  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0001  tRNA-Arg  91.49 
 
 
76 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5037  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0042  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  86.21 
 
 
79 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA30  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.179401 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  86.21 
 
 
79 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0033  tRNA-Arg  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.49867  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0104  tRNA-Arg  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0048  tRNA-Arg  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13672  tRNA-Arg  91.89 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.126339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3177t  tRNA-Arg  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0004  tRNA-Arg  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.710859  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0050  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.51263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3789  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0038  tRNA-Arg  83.56 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0080  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.833302  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0064  tRNA-Arg  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  86.54 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0049  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0043  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0064  tRNA-Arg  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0009    100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.956254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0023  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165773  normal  0.561147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  85 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  85 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  86.54 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00007  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0023  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0954  tRNA-Arg  84.75 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0029  tRNA-Arg  85.45 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00115694  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t16  tRNA-Arg  84.75 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0067  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0058  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.11838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0016  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.228908 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0638  tRNA-Arg  84.75 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.737204  normal  0.415915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0003  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.304599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4647  tRNA-Arg  84.75 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.695666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0241  tRNA-Arg  84.75 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.628692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5013  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0582  tRNA-Arg  84.75 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0081  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  84.85 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  84.85 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_654  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.026244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  84.85 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  84.85 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  84.85 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0082  tRNA-Arg  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0073  tRNA-Pro  100 
 
 
101 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  84.85 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  84.85 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0043  tRNA-Arg  85.19 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  84.85 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>