127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_R0042 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0016  tRNA-Arg  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.228908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0033  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.49867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0046  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1714  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2749  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  89.06 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1748  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0337298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0024  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1514  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1545  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0924  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t41  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0465377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0030  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000202832  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0013  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0046  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.426142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1960  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0008  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.894814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0051  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0048  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0029  tRNA-Arg  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00115694  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0040  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849707  normal  0.98393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0023  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.2030600000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0041  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00815383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0050  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0005  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0035  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.16654  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0042  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0042  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000631385  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0038  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 80 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0034  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0017  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0049  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0049  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0067  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0019  tRNA-Arg  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0987359  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0035  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0001  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0037  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0828388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0030  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0160344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  90 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5037  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0003  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0123  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.553606  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0017  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.915469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0787  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.506305  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0054  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0104  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>