64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0011 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.264666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.464921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0038  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.903722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0059  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925034  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0057  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0595904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0023  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165773  normal  0.561147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0032  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.717284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0049  tRNA-Arg  94.34 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0046  tRNA-Arg  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0004  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.710859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0048  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0064  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.51263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna24  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0030  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0053  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673095  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0024  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.242795  normal  0.395578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0029  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00115694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0049  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0085  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000064682  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_654  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.026244  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0064  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0050  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0013  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0697011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0054  tRNA-Arg  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0462421  normal  0.0117618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24430  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257328  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1721  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.422722  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0080  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.833302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0160344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0050  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0828388  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1441  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0001  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0008  tRNA-Arg  83.1 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0060  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0005  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0082  tRNA-Arg  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000168657  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t41  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0465377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0030  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.474637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13672  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.126339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4575  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0002  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000973138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0016  tRNA-Arg  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0047026  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1960  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0008  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.894814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>