298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_t13672 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_t13672  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.126339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01392  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0021  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548378  normal  0.148026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3177t  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0075  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna129  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  88.41 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0057  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3789  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0080  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.833302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0081  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000923685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0083  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000215013  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1415  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0043  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  86.36 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0079  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000061602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0027  tRNA-Arg  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0275955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0008  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1532  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0023  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165773  normal  0.561147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA30  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.179401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0026  tRNA-Arg  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0003  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4570  tRNA-Arg  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0027  tRNA-Arg  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.005  hitchhiker  0.000281231 
 
 
-
 
NC_002950  PGt45  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0023  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601001  normal  0.725234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0080  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000233743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0077  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000716248  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309129  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.751283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0049  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0036  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0082  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302683  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_654  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.026244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0017  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0421283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0030  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.474637  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0050  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0029  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.159336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0019  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0004  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0017  tRNA-Arg  84.85 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0024  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.242795  normal  0.395578 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0020  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211793  normal  0.0116052 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0042  tRNA-Arg  84.85 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0027  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0029  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000030616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0028  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0030  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0030  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000300498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna45  tRNA-Arg  84.85 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0032  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.717284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA24  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0033    100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.465257  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0038  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.903722  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54758  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.480879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60330  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.665088  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0800  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000572817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000538631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0059  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.925034  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0057  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0595904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>