More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1022 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1022  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
379 aa  780    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5070  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.35 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356872  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.94 
 
 
372 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.82 
 
 
370 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.89 
 
 
377 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.93 
 
 
403 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.02 
 
 
403 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.1 
 
 
378 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  31.94 
 
 
391 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.73 
 
 
386 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.58 
 
 
388 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.73 
 
 
382 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.28 
 
 
378 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.04 
 
 
382 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  31.67 
 
 
391 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.68 
 
 
390 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.48 
 
 
382 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.39 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.55 
 
 
389 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.49 
 
 
390 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.46 
 
 
384 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.81 
 
 
373 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.95 
 
 
387 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.49 
 
 
391 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.09 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6746  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.04 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  29.37 
 
 
401 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.43 
 
 
394 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.31 
 
 
382 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5866  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.04 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0167811  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  30.28 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.88 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.88 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  29.91 
 
 
382 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.37 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2447  putative mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.7 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549803  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  30.22 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.81 
 
 
391 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  30.39 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  30.29 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  30.3 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1717  putative racemase  30.97 
 
 
359 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0822  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.83 
 
 
370 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  26.37 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  26.37 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  29.95 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  30.03 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.43 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.31 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  29.95 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  29.95 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  29.95 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.93 
 
 
396 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.88 
 
 
379 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.89 
 
 
404 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4045  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.93 
 
 
396 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3563  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.2 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851149  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.02 
 
 
425 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.57 
 
 
390 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.99 
 
 
398 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.57 
 
 
390 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4861  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.11 
 
 
388 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.42 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0154  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.25 
 
 
398 aa  125  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.434953  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1036  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.37 
 
 
404 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.6 
 
 
405 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679243  normal  0.849067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  31.09 
 
 
382 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2021  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.54 
 
 
362 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2617  mandelate racemase  26.37 
 
 
400 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588885  normal  0.211139 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3673  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.19 
 
 
410 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232525  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3671  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
388 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2513  mandelate racemase  26.37 
 
 
400 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.440237  normal  0.0724209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2277  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.87 
 
 
402 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.612864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2709  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.89 
 
 
398 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0606445  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2458  mandelate racemase  26.37 
 
 
400 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0484555  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.61 
 
 
378 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000249838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.68 
 
 
396 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  29.01 
 
 
382 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  29.64 
 
 
502 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.3 
 
 
401 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0802  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.11 
 
 
404 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  30.17 
 
 
381 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2380  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.57 
 
 
400 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162609  normal  0.98097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1992  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.58 
 
 
405 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.589725 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1675  starvation sensing protein RspA  27.49 
 
 
404 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1834  starvation sensing protein RspA  27.49 
 
 
404 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.768737  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2635  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.68 
 
 
404 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0759429  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1607  starvation sensing protein RspA  27.49 
 
 
404 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1667  starvation sensing protein RspA  27.49 
 
 
404 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8006  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.36 
 
 
386 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01550  predicted dehydratase  26.89 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2062  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.89 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0579559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1788  starvation-sensing protein RspA  26.89 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2049  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.89 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.362051  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  28.73 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  28.73 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  28.73 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1616  starvation sensing protein RspA  27.49 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01540  hypothetical protein  26.89 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>