44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0600 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0600  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1035    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  29.23 
 
 
1428 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  32.69 
 
 
899 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  27.56 
 
 
1424 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.27 
 
 
898 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.26 
 
 
913 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.23 
 
 
888 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  39.85 
 
 
739 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  32.56 
 
 
1951 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  28.99 
 
 
549 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  29.81 
 
 
5743 aa  57.4  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  29.95 
 
 
2042 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  34.62 
 
 
1804 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  31.22 
 
 
4106 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.49 
 
 
2552 aa  54.3  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.92 
 
 
3586 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  34.57 
 
 
913 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  29.11 
 
 
916 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.08 
 
 
1332 aa  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.61 
 
 
1762 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  24.71 
 
 
1902 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.69 
 
 
2350 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  23.94 
 
 
3925 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  24.77 
 
 
2528 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  28.46 
 
 
1461 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  35.09 
 
 
777 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  24.07 
 
 
1570 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  28.57 
 
 
3562 aa  47  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  31 
 
 
2704 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  27.25 
 
 
1219 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  27.33 
 
 
1222 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  24.69 
 
 
4874 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0957  OmpA/MotB domain protein  30.97 
 
 
716 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0225193  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.5 
 
 
5216 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  30.25 
 
 
1621 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  30.05 
 
 
1096 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  28.38 
 
 
1452 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  23.81 
 
 
5561 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  23.81 
 
 
5561 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  23.81 
 
 
5561 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.16 
 
 
1919 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  25.99 
 
 
4689 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  23.81 
 
 
5559 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  23.81 
 
 
5559 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>