More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2990 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 198 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  63.54 
 
 		 183 aa  250  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  63.58 
 
 		 174 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  66.67 
 
 		 321 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  62.64 
 
 		 175 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  64.67 
 
 		 323 aa  241  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  61.05 
 
 		 353 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  62.21 
 
 		 260 aa  233  9e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  63.47 
 
 		 328 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  61.05 
 
 		 320 aa  230  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  56.84 
 
 		 321 aa  228  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  60.71 
 
 		 321 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  58.96 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  60.12 
 
 		 321 aa  224  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  60.12 
 
 		 321 aa  224  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  60.12 
 
 		 321 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  60.12 
 
 		 321 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  60.12 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.32 
 
 		 321 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 		 368 aa  221  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.32 
 
 		 321 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.52 
 
 		 321 aa  220  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  61.08 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  61.08 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  61.08 
 
 		 178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  61.08 
 
 		 178 aa  215  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 178 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  59.32 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  59.88 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 178 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  58.33 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 178 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 		 178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  54.89 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  56.14 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  57.31 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  56.98 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  55.81 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  56.02 
 
 		 242 aa  204  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  47.19 
 
 		 381 aa  202  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  52.98 
 
 		 169 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  52.2 
 
 		 397 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 		 380 aa  197  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  52.91 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 		 416 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  51.74 
 
 		 416 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  50.59 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  53.53 
 
 		 175 aa  191  6e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 351 aa  191  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  53.07 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  48.33 
 
 		 380 aa  190  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  47.83 
 
 		 394 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  52.35 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  51.19 
 
 		 280 aa  187  8e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  56.58 
 
 		 171 aa  187  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  55.26 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  53.9 
 
 		 197 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  54.49 
 
 		 171 aa  181  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  53.74 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  49.09 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  52.98 
 
 		 181 aa  177  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  51.66 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  50.66 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  58.22 
 
 		 182 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  52.63 
 
 		 182 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1596  peptide methionine sulfoxide reductase  55.17 
 
 		 156 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  45.86 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  52 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  52.26 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  50.68 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  47.74 
 
 		 228 aa  167  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  50.98 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  48.7 
 
 		 225 aa  165  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  45.81 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  49.32 
 
 		 180 aa  165  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 		 266 aa  164  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  52.74 
 
 		 150 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  50.34 
 
 		 156 aa  160  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  43.6 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  50.68 
 
 		 158 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  46.29 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 		 164 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  46.98 
 
 		 155 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  48.19 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>