More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1528 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  57.47 
 
 		 223 aa  276  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.22 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  54.3 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 223 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  45.37 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  44.93 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 		 228 aa  227  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  50.67 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  47.06 
 
 		 221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  44.09 
 
 		 224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  41.26 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  41.26 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  40.81 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  39.91 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  38.67 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1910  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 222 aa  177  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1787  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03380  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.61 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0172  response regulator  35.24 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  36.2 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  34.98 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  34.98 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  34.98 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  34.98 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  34.98 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  34.98 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  34.98 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  33.66 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  34.98 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  34.98 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  34.38 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  32.43 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  34.39 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  32.88 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  34.63 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  34.96 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 231 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.74 
 
 		 237 aa  144  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>