More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0777 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  100 
 
 		 456 aa  930    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  55.5 
 
 		 450 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  53.44 
 
 		 451 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  54.2 
 
 		 458 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  43.71 
 
 		 444 aa  363  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  46.45 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  42.86 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  43.34 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  42.73 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  43.26 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  42.73 
 
 		 458 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  41.57 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  41.57 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  41.11 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  41.11 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  41.57 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  41.34 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  41.57 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  41.11 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  40.18 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  41.94 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  39.59 
 
 		 461 aa  312  9e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  41.38 
 
 		 458 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  41.38 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  40.78 
 
 		 459 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  40.05 
 
 		 460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  40.55 
 
 		 443 aa  302  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  39.82 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  39.82 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  39.95 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  37.1 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  40.69 
 
 		 455 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  40.83 
 
 		 455 aa  288  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  41.61 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  41.42 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  39.54 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  40.41 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  39.22 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  40.69 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  39.91 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  38.27 
 
 		 459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  38.76 
 
 		 472 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  38.27 
 
 		 454 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  38.05 
 
 		 454 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  38.32 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  39.72 
 
 		 445 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  39.72 
 
 		 445 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  38.93 
 
 		 439 aa  279  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  39.74 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  39.04 
 
 		 455 aa  277  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  38.67 
 
 		 472 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  40.63 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  39.49 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  41.49 
 
 		 472 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  41.49 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  41.49 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  41.49 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  41.49 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  41.49 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  41.49 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  41.49 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  41.22 
 
 		 472 aa  266  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  37.47 
 
 		 464 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  36.11 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  37.24 
 
 		 464 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  37.01 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2226  glutamine synthetase family protein  36.99 
 
 		 456 aa  246  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  34.11 
 
 		 465 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  34.62 
 
 		 445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  35.76 
 
 		 444 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  35.76 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  34.16 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  33.56 
 
 		 444 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  35.54 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  34.24 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  36.72 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2031  glutamate--ammonia ligase  35.83 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  34.17 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0377  L-glutamine synthetase  35.83 
 
 		 451 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1838  L-glutamine synthetase  36.34 
 
 		 455 aa  229  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277584  normal  0.270137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2380  glutamate--ammonia ligase  34.93 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2994  glutamate--ammonia ligase  34.93 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  34.29 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  35.6 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  34.29 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  33.94 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  35 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  33.94 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  33.94 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  33.94 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  33.11 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  33.94 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  34.96 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6343  L-glutamine synthetase  35.08 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  34.48 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  34.73 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3013  glutamate--putrescine ligase  34.47 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  35.36 
 
 		 450 aa  227  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  33.72 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  33.94 
 
 		 445 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>