More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5638 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 424 aa  868    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  54.85 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  55.16 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  54.35 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  54.82 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  54.01 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  51.51 
 
 		 431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 		 423 aa  428  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  48.84 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  45.97 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  46.71 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  47.18 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  46.84 
 
 		 442 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  46.24 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  46.98 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  45.67 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 		 432 aa  359  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  45.9 
 
 		 432 aa  358  9e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  45.14 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  45.14 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  45.14 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  45.14 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  45.14 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  45.14 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  45.14 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  45.14 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  45.14 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  45.41 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  44.91 
 
 		 432 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  44.91 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  44.91 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  44.91 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  44.91 
 
 		 432 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  46.37 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  45.41 
 
 		 433 aa  356  5e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 431 aa  356  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  47.66 
 
 		 431 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  46.06 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  45.37 
 
 		 427 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  44.29 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  44.29 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  44.29 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  46.3 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  45.92 
 
 		 431 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  45.83 
 
 		 430 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  46.5 
 
 		 431 aa  353  5e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  45.83 
 
 		 430 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  45.83 
 
 		 430 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  44.91 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 431 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  44.73 
 
 		 432 aa  352  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  47.56 
 
 		 431 aa  352  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  45.52 
 
 		 438 aa  352  8.999999999999999e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 		 432 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 431 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 431 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 431 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 431 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  43.91 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 431 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  47.1 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  46.65 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 		 431 aa  349  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 431 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  46.88 
 
 		 431 aa  349  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  46.84 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  45.06 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  43.36 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  45.81 
 
 		 429 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  45.96 
 
 		 430 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  45.96 
 
 		 430 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  45.65 
 
 		 430 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  46.6 
 
 		 430 aa  345  8e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  44.13 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  43.6 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  43.43 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  44.44 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  43.16 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  44.44 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  46.37 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  44.5 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  47.03 
 
 		 428 aa  342  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  44.65 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 431 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  43.75 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>