81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4482 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4482  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  27.61 
 
 		 674 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  24.12 
 
 		 637 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  24.55 
 
 		 614 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  26.37 
 
 		 612 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  27.27 
 
 		 669 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  26.42 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.14 
 
 		 688 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  27.61 
 
 		 657 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.38 
 
 		 616 aa  62  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.33 
 
 		 619 aa  61.6  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.14 
 
 		 674 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  27.54 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  26.83 
 
 		 680 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.14 
 
 		 674 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.86 
 
 		 788 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  25.56 
 
 		 660 aa  58.5  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  27.72 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.53 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  30.53 
 
 		 637 aa  57  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  30.53 
 
 		 637 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  30.19 
 
 		 738 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  26.67 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  25.81 
 
 		 617 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.29 
 
 		 622 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.29 
 
 		 622 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.29 
 
 		 622 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5003  hypothetical protein  25.13 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000123501  hitchhiker  0.0000143194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  22.91 
 
 		 705 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  26.14 
 
 		 719 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1580  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  22.86 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.924484  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2271  hypothetical protein  27.08 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3150  magnesium chelatase subunit ChlD  22.29 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3505  hypothetical protein  27.08 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0313202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1644  hypothetical protein  24.28 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000465532  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.56 
 
 		 673 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  23.5 
 
 		 776 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  26.38 
 
 		 713 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  24.38 
 
 		 329 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  26.82 
 
 		 670 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2771  hypothetical protein  24.74 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0273  putative magnesium chelatase  25.25 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0735545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  26.28 
 
 		 680 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1611  Mg-chelatase subunit ChlD  25.25 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.193118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0887  hypothetical protein  25.25 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00821077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1957  protoporphyrin IX magnesium chelatase  25.25 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1941  protoporphyrin IX magnesium chelatase  25.25 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.4 
 
 		 665 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  23.47 
 
 		 696 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  23.89 
 
 		 626 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2102  hypothetical protein  25.25 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  27.5 
 
 		 699 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  23.77 
 
 		 653 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  24.74 
 
 		 620 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  24.23 
 
 		 636 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  25.14 
 
 		 643 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.2 
 
 		 618 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  24.74 
 
 		 618 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2405  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  23.43 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.13 
 
 		 619 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.14 
 
 		 619 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  25.41 
 
 		 650 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 		 792 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2424  hypothetical protein  25.65 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.076736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1578  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  22.17 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  24.06 
 
 		 621 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  22.03 
 
 		 638 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5744  hypothetical protein  26.03 
 
 		 153 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  hitchhiker  0.0000337383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26000  putative magnesium chelatase  25.9 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203244  normal  0.298809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  27.5 
 
 		 592 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  23.59 
 
 		 618 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  24.12 
 
 		 689 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1559  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  23.26 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4808  Mg-chelatase subunit ChlD-like  19.89 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3147  hypothetical protein  21.69 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189383  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  28.48 
 
 		 566 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  26.4 
 
 		 580 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  28.8 
 
 		 573 aa  42  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  25.52 
 
 		 690 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>