54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4038 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  41.63 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  31.75 
 
 		 278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  31.32 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  35.51 
 
 		 625 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  35.63 
 
 		 626 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  35.22 
 
 		 626 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  34.51 
 
 		 626 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  30.47 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  29.01 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  29.55 
 
 		 500 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  27.82 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  30.27 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  30.71 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  27.13 
 
 		 282 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  25.48 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  27.41 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  26.95 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  29.18 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  29.38 
 
 		 289 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  27.76 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  26.04 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  34.06 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  32.95 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  29.84 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  28.24 
 
 		 284 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  30.04 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  27.2 
 
 		 275 aa  92  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  32.14 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  28.4 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  25.98 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  28.9 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  28.79 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  32.8 
 
 		 284 aa  86.3  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  25.88 
 
 		 304 aa  85.1  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  28.63 
 
 		 273 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  28.24 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  25.1 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  25.49 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  32.82 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  30.65 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  23.85 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  30.48 
 
 		 285 aa  75.1  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  24.71 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  34.71 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  23.17 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  25.2 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  24.17 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  24.39 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  24.17 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  23.14 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  24 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  24.66 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  24.06 
 
 		 245 aa  42  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>