70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3922 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1022    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  49.34 
 
 		 517 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  48.59 
 
 		 522 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  48.39 
 
 		 517 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  47.18 
 
 		 497 aa  428  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  43.65 
 
 		 498 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  41.65 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  41.11 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  40.63 
 
 		 470 aa  346  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  39.85 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  49.06 
 
 		 700 aa  252  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  52.81 
 
 		 649 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  33.06 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  33.06 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  52.66 
 
 		 697 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  54.21 
 
 		 394 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  29.26 
 
 		 638 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  28.6 
 
 		 405 aa  163  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  27.75 
 
 		 522 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  29.51 
 
 		 521 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  38.33 
 
 		 522 aa  156  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  37.22 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  35.94 
 
 		 781 aa  153  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  43.01 
 
 		 660 aa  153  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  26.98 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  40.31 
 
 		 690 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  41.18 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  37.88 
 
 		 585 aa  147  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  43.62 
 
 		 401 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  40.84 
 
 		 521 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  40.62 
 
 		 521 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  29 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  42.63 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  39.25 
 
 		 724 aa  140  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  40.96 
 
 		 521 aa  140  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  38.12 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  36.79 
 
 		 542 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  36 
 
 		 599 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  40.74 
 
 		 569 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  38.22 
 
 		 821 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  37.77 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  28.53 
 
 		 544 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  34.42 
 
 		 644 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  40.74 
 
 		 514 aa  134  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  35.56 
 
 		 509 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  39.04 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  38.59 
 
 		 1117 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  37.17 
 
 		 802 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  37.1 
 
 		 596 aa  124  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  33.2 
 
 		 585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  37.25 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  32.04 
 
 		 734 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  33.69 
 
 		 686 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  25.42 
 
 		 509 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  25.42 
 
 		 509 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  33.18 
 
 		 509 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  28.18 
 
 		 740 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  28.18 
 
 		 740 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  27.03 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  25.82 
 
 		 387 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  32.37 
 
 		 400 aa  50.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.78 
 
 		 386 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  23.9 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  27.46 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  26.67 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  26.52 
 
 		 386 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  26.62 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  27.59 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  27.59 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  25.27 
 
 		 501 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>