136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3767 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3767  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 128 aa  253  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0691716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  80 
 
 		 134 aa  196  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1218  negative regulator of sigma-B  81.2 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1672  negative regulator of sigma-B  76.92 
 
 		 132 aa  184  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3136  anti-sigma-factor antagonist  67.19 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0981532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2415  anti-sigma-factor antagonist  65.25 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3134  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  63.56 
 
 		 120 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0800  anti-sigma-factor antagonist  65.49 
 
 		 123 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0977014  hitchhiker  0.00820415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0511  anti-sigma-factor antagonist  63.56 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3340  anti-sigma-factor antagonist  63.56 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5230  anti-sigma-factor antagonist  63.11 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1493  anti-sigma-factor antagonist  62.2 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.423658  normal  0.0757983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0130  anti-sigma-factor antagonist  62.71 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5778  anti-sigma-factor antagonist  58.4 
 
 		 125 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2487  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  59.32 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2971  anti-sigma-factor antagonist  62.6 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2268  anti-sigma-factor antagonist  62.61 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2794  anti-sigma-factor antagonist  60 
 
 		 125 aa  141  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3743  anti-sigma-factor antagonist  60.18 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4410  anti-sigma-factor antagonist  58.62 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4971  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  57.52 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0475  anti-sigma-factor antagonist  56.52 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0163  anti-sigma-factor antagonist  51.75 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.438455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0676  anti-sigma-factor antagonist  51.75 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483964  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0736  anti-sigma-factor antagonist  49.21 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2683  anti-sigma-factor antagonist  50.89 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32010  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  49.12 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0737154  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3858  anti-sigma-factor antagonist  53.77 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1474  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.94 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000611379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3438  anti-sigma-factor antagonist  41.44 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0775335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0140  anti-sigma-factor antagonist  42.98 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00670241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1811  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 		 124 aa  87  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6566  anti-sigma-factor antagonist  38.26 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778948  normal  0.044329 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0693  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0196  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0995683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 372 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  35.23 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 385 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 380 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 549 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 		 556 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 281 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 421 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 357 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  40.54 
 
 		 357 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  29.51 
 
 		 521 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 372 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 286 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 361 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  37.97 
 
 		 667 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 295 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 371 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  33.75 
 
 		 428 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 439 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 298 aa  50.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  33.75 
 
 		 430 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 388 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 		 295 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.46 
 
 		 272 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 308 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 283 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 422 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  35.9 
 
 		 509 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  28.93 
 
 		 365 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 365 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  28.81 
 
 		 523 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 370 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  32.91 
 
 		 271 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  27.06 
 
 		 694 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  33.75 
 
 		 562 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  26.88 
 
 		 323 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 312 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 376 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 366 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  33.78 
 
 		 286 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 359 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 445 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 284 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 271 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 285 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  30.09 
 
 		 261 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 		 357 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.8 
 
 		 285 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 280 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 288 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  27.96 
 
 		 538 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 287 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.86 
 
 		 284 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  33.8 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 290 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 367 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 365 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 361 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  28.75 
 
 		 293 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>